未来世界，感染了X病毒的恶魔党携带威力强大的赤盾出现在地球各个角落。仅仅是七天的时间，地球一半的领土便宣告陷落。人们流离失所，躲在最后的保留地苟延残喘。国际科学技术厅（ISO）的南部博士（岸谷五朗 饰）发现一种神秘的石头可以赋予特定人群以强大的力量，而力量提升后的超级战士正是阻挡恶魔党的不二人选。在此之后，鹫尾健（松坂桃李 饰）、大月纯（刚力彩芽 饰）、大月甚平（滨田龙臣 饰）和中西龙（铃木良平 饰）等人得到ISO的发掘，经过连番常人难以想象的特训，他们成长为对抗恶魔党的科学忍者队战士。某次战斗后，健的老友浅仓乔治（绫野刚 饰）加入进来，他们奉命去保护恶魔党逃亡过来的头目伊利亚（中村狮童 饰），以期获取Last Suicide计划的详情。　　面对这个有着深仇大恨的敌人，健和乔治的内心悄悄发生着变化…….

103.78.152.*：2013年真是科幻黄金年代，好片层出不穷！

36.26.33.*：有人是因为喜欢松坂桃李,绫才看的这部的吗？

116.7.161.*：为什么国语声音好小，你们声音大吗？

123.119.20.*：特别喜欢看科幻，还有其他科幻推荐吗？

166.10.165.*：找了好久科学小飞侠，终于找了，想看个国语版太不容易了！

114.238.99.*：科学小飞侠是2013最好看的科幻。

112.24.228.*：科学小飞侠好看吗？我还没看

222.175.19.*：为什么科学小飞侠下载总是在99%卡住了！！！

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